Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX29Q8TEQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX29Q8TEQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms