Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HELBQ8NG08 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELBQ8NG08 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms