Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC197Q8NCU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms