Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNBD1Q8NA66 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms