Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD42Q8N9B4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD42Q8N9B4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms