Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYB561D1Q8N8Q1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYB561D1Q8N8Q1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms