Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF1Q8N6C5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF1Q8N6C5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms