Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM199Q8N511 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM199Q8N511 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms