Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SVBPQ8N300 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SVBPQ8N300 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms