Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
VWDEQ8N2E2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms