Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM2Q86SE8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms