Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC29A4Q7RTT9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms