Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTOP1Q7RTM1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP1Q7RTM1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms