Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms