Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCBE1Q6UXH8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCBE1Q6UXH8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms