Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LARP1Q6PKG0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LARP1Q6PKG0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms