Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO38Q6PIJ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO38Q6PIJ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms