Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTR9Q6PD62 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTR9Q6PD62 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms