Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMOD2Q6P5Q4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD2Q6P5Q4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms