Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ANKRD54Q6NXT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ANKRD54Q6NXT1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms