Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SWSAP1Q6NVH7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWSAP1Q6NVH7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms