Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMBOX1Q6NT76 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HMBOX1Q6NT76 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms