Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USPL1Q5W0Q7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms