Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RSBN1Q5VWQ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RSBN1Q5VWQ0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms