Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOGA3Q5TF21 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms