Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CEP170Q5SW79 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CEP170Q5SW79 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CEP170Q5SW79 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms