Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUP188Q5SRE5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms