Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMPD3Q5JV73 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms