Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC92Q53HC0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms