Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDCCQ504Y2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms