Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LSM12Q3MHD2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LSM12Q3MHD2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms