Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ISXQ2M1V0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ISXQ2M1V0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms