Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B3Q16720 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B3Q16720 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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