Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXNQ16595 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FXNQ16595 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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