Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CARTPTQ16568 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms