Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GABRA6Q16445 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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GABRA6Q16445 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRA6Q16445 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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