Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS72Q15906 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS72Q15906 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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