Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85BQ15834 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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