Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HERC3Q15034 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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