Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERPUD1Q15011 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms