Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ERV3-1Q14264 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ERV3-1Q14264 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ERV3-1Q14264 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ERV3-1Q14264 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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ERV3-1Q14264 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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ERV3-1Q14264 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERV3-1Q14264 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms