Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTAN1Q13813 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTAN1Q13813 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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