Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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