Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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