Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NAE1Q13564 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NAE1Q13564 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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