Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LSAMPQ13449 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LSAMPQ13449 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms