Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLF1Q13351 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLF1Q13351 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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