Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDRQ13258 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGDRQ13258 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms