Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1H3Q13133 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NR1H3Q13133 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NR1H3Q13133 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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