Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TROQ12816 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TROQ12816 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TROQ12816 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TROQ12816 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TROQ12816 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TROQ12816 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TROQ12816 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TROQ12816 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TROQ12816 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TROQ12816 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
TROQ12816 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
TROQ12816 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TROQ12816 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TROQ12816 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TROQ12816 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TROQ12816 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TROQ12816 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TROQ12816 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TROQ12816 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TROQ12816 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
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